Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MCF2P10911 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MCF2P10911 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MCF2P10911 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MCF2P10911 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms