Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CBSLP0DN79 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms