Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2AF1L5P0DN76 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2AF1L5P0DN76 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms