Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEFLP07196 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFLP07196 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFLP07196 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFLP07196 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NEFLP07196 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEFLP07196 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEFLP07196 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms