Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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