Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CBX7O95931 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX7O95931 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms