Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1AO95602 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms