Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CYTIPO60759 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms