Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCEO43556 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCEO43556 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCEO43556 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCEO43556 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SGCEO43556 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCEO43556 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCEO43556 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCEO43556 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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