Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYNJ2O15056 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNJ2O15056 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms