Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM6BO15054 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM6BO15054 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms