Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN6O00399 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DCTN6O00399 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms