Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD8-MDP1E9PL57 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms