Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG3

FAM25A, Protein FAM25A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25AB3EWG3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM25AB3EWG3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms