Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC00587B1AMM8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms