Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
STRCP1A6NGW2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms