Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms