Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM3A6NDB9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms