Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNX8Q9Y5X2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms