Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RHBDD3Q9Y3P4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms