Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
YBX2Q9Y2T7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms