Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INO80Q9ULG1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INO80Q9ULG1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms