Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF346Q9UL40 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms