Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NPC1L1Q9UHC9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms