Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DKK4Q9UBT3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms