Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL13Q9P2N7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms