Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCHIP1Q9P0W5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms