Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms