Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HACD3Q9P035 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HACD3Q9P035 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms