Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NKIRAS2Q9NYR9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms