Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms