Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFGAP3Q9NP61 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms