Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRA1Q9HD15 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms