Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KIAA1549Q9HCM3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIAA1549Q9HCM3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms