Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
NRDE2Q9H7Z3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NRDE2Q9H7Z3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms