Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.9 ms