Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms