Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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FOXQ1Q9C009 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXQ1Q9C009 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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