Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ROPN1BQ9BZX4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms