Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA7Q9BWT1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA7Q9BWT1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms