Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CENPKQ9BS16 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CENPKQ9BS16 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms