Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FYCO1Q9BQS8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FYCO1Q9BQS8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms