Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPA33Q99795 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPA33Q99795 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms