Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2E2Q96LR5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2E2Q96LR5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2E2Q96LR5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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UBE2E2Q96LR5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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UBE2E2Q96LR5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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