Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD3Q96L08 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD3Q96L08 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD3Q96L08 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD3Q96L08 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD3Q96L08 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD3Q96L08 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SUSD3Q96L08 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SUSD3Q96L08 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms