Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms