Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms