Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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