Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM54Q969K7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms