Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP13Q92995 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP13Q92995 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
USP13Q92995 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms